索加和古桥在战斗地点巡逻时发现怪兽的尸体不见了，只剩下被赛文砍下的一臂一腿在地上。
两人正狐疑，通讯器传来防卫军基地遭受攻击的消息，戈斯星人向防卫军发起攻击，基地严重受创，仓田要求驾驶奥特飞鹰出击迎战，桐山阻止了他，顶盖一旦打开，整个基地就全暴露了，仓田只能耐着性子。
古桥和索加两人连忙赶回支援，激战中敌人的飞船中弹了，但是飞船逃逸至熊岳山附近就消失了。两人回到基地汇报时，安奴跑进来说，团不见了。
仓田冷笑着奚落道，“这一次逃走了，这家伙是奥特警备队的耻辱。”
索加反驳道：“不是，团不是那种人！”
“他没有逃？为什么隐蔽起来了？难道他是害怕这种工作吗？”
“你……你不了解他！”
“我还不想了解没用的家伙呢！”戈斯星人向人类发出通牒，他们利用天成向地球防卫军提出要求：要人类让出地球，全体人类移居到火星的地下城市。否则将用地下导弹攻击各大城市。
人类的天空和陆地防守虽然都很严密，但地下的防守却是空白。
仓田队长首先反对，队员们也纷纷附和，“在地下屈辱地生活还不如死了的好”。
山冈长官带着真波和竹中两位参谋来了，开始研究对策以求拖延时间，并命令奥特警备队尽快找出戈斯星人的基地。
小池家的姐弟俩在路边发现了昏昏沉沉的团，他正在猎犬号里休息。
团是宇宙人，一旦照x光，身份就会暴露，所以他趁人不注意，离开了基地。
姐弟俩请团到他们家去，团躺在男孩的床上，男孩告诉团，他长大了也要参加奥特警备队。
团听到男孩的姐姐在楼下打电话请大夫，他借口害怕打针不愿看医生，于是男孩把他带到他和小伙伴们的秘密基地。
在那团从收音机里听到戈斯星人发起进攻的消息，心急如焚。
他想去战斗，可是男孩拦住了他，“不行，你这样的身体……”男孩告诉他哪里也不要去，就跑了出去。
戈斯星人袭击了世界其他大城市，那些城市在顷刻间灰飞烟灭。
戈斯星人发出最后通牒，如果30分内再不做出回答，下一个目标将是东京。
30分钟，就连开对策会议也来不及啊！京城市民纷纷开始逃难。经过古桥、索加和仓田的仔细搜索，发现戈斯星人利用熊岳山的火山口作为基地的出入口，在地下建造了庞大的基地。
讨论决定将地下战车设定成自动操作，装满炸药攻入戈斯星人的基地将它引爆。
可是天成怎么办？索加要求独自去救天成，仓田阻止了他。
为了地球，为了人类，只能牺牲天成队员。
通过通讯器了解到一切的团再也按耐不住，他必须去战斗。
团跑出房间举起奥特眼镜，又看见赛文站在面前阻止他，“住手，住手赛文奥特曼，这次真的会死的！”这时身后一道车灯射来，团忙收起眼镜，原来是安奴。
“一个叫秋夫的孩子告诉我你在这儿，为什么要逃跑，团，回答我。”
“安奴，我不是人类，是从m78星云来的赛文奥特曼……你很吃惊吧？”
“嗯，人类也好，宇宙人也好，团就是团，是不会改变的。即使你是赛文奥特曼。”
“谢谢你，安奴。如我所说，我不得不回到m78星云，当西边的天空，启明星发光的时候，有一束光将飞向宇宙，那就是我，再见了，安奴！”
基地里，桐山队长发出命令：“地下战车，出动！”飞驰的地下战车载着炸弹冲向敌人了的地下基地,天成队员危在旦夕。www.ýáńbkj.ćőm
地面上，听完了团的叙述，安奴的眼泪止不住地流下，“等等，团，不要去！”
“天成队员有危险！”团一把推开安奴变身为赛文，向火山飞去。
赛文飞进敌人的地下基地救出天成，地下战车也几乎同时赶到，引爆了整个基地。正当队员们赶到救出天成，被安上了金属腿臂的怪兽庞敦也破土而出，赛文以疲惫之躯再度迎战。
安奴向众人讲述了团的真实身份，“其实赛文奥特曼就是我们的团——从m78星云来的和平使者，为保卫地球战斗。但这是最后的战斗了，团要回自己的星球去了。”
众人都震惊不已。
“团！……地球要靠我们自己的手来守卫了！”桐山队长下令道。
奥特飞鹰1号升空，分成三部分出击！古桥：“团，快回去，怪兽交给我！”
天成：“团！”
安奴：“团在拼死作战！”
桐山：“他身体状况那么不好，为什么不早说？”
仓田：“团，对不起！”索加：“危险！”
赛文和庞敦的战斗已经接近白热化。
赛文发出的头镖被反而庞敦接住。
庞敦手持头镖逼进赛文，紧要关头仓田队长向庞敦发起攻击。
庞敦扔出了头镖，但被赛文利用念力把庞敦的头切断。
黎明渐渐来临，赛文踉踉跄跄地站起来，飞向了宇宙，化为一道金色的光消失在空中，化作一颗明亮的星星。
队员们站在空地上望着遥远的天边，神情黯然。
天成：“团是死了回去的，如果是那样杀死团的是我们地球上的人！”
索加：“他拖着受伤的身体，直到最后还在为人类战斗！杀死团的是我们！他真是个好人！”
古桥：“说什么呀！团能死吗！团活着从遥远的宇宙那边守护着我们的地球，然后还会神采奕奕的回来的！”
渐明的天空下，队员们似乎看到团正微笑着向他们跑来………
在这个氛围之下，赛文奥特曼的故事也是落幕了。
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